Как организовать лабораторные измерения?

Проводить надо после пусконаладки системы, но до подачи документов, вы правы. Если по результатам параметры не добираются, систему регулируют и замеры повторяют, поэтому закладывайте на это время и деньги в бюджет заранее. Это обычная практика, а не форс-мажор. Мы делали через Рентген-Центр https://rentgen-centr.ru/proverka-ventilyacii/ , у них это отдельная услуга и можно совместить выезд с радиационным контролем кабинета, что сэкономило нам один этап. Совет: потребуйте от монтажников акты пусконаладки с фактическими параметрами до вызова лаборатории. Если у них цифры не сходятся с проектом, лучше узнать это до того, как вы оплатите независимые замеры.